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列報商品盤損，其存貨必須採永續盤存制或經核准採零售價法，才能適用，並應於事實發生後30日內檢具清單報請該管稽徵機關調查，或經會計師盤點並提出查核簽證報告或年度所得稅查核簽證報告，經查明屬實，得列報為當年度損失。
若依商品性質可能發生自然損耗或滅失情事，如化學藥品自然揮發，營利事業無法提出證明文件，依營利事業所得稅查核準則第101條第3款規定，如營利事業會計制度健全，經實地盤點結果，商品盤損率在1%以下時，可直接認定商品盤損。
例》近日查核某公司109年度營利事業所得稅申報案件時，發現該公司列報商品盤損200萬元，盤損率雖未達1%，但該公司以員工自行盤點存貨紀錄做為證明文件，未提供報請國稅局調查核准文件、或經會計師盤點查核簽證報告，且商品盤損為建材五金，依性質不可能發生自然損耗或滅失情事，因此剔除補稅。

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